本发明公开了一种定量检测广东虫草的特征性核苷酸序列、核酸分子引物和方法。定量快速检测广东虫草的特征性核苷酸序列,其核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。定量快速检测广东虫草的核酸分子引物,该核酸分子引物为:FS:5`‑GCTCCGATTCGATGGC‑3`;RS:5`‑TACAGCAGGCAGGTGGC‑3`。利用本发明的核酸分子引物FS和RS进行荧光PCR扩增,仅广东虫草能够激发荧光信号,而其他虫草如冬虫夏草、蛹虫草和分枝虫草均在循环数小于35时均无Ct值,表明了本发明的核酸分子引物FS和RS具有很高的特异性,可以用于快速检测广东虫草(菌丝体和子实体)及其相关制品的真伪和含量。