本发明公开了一种鉴别广东虫草的特征性核苷酸序列、核酸分子探针和方法。该特征性核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。该核酸分子探针为GDF：5′-CTGTTGGCATCTTCTGAGTCTC-3′；GDR：5′-GGTGCGAGGTTGTGCTACTA-3′。其方法为是采用上述核酸分子探针GDF和GDR作为PCR引物，利用PCR方法鉴定广东虫草，具体步骤按常规PCR方法进行。本发明以GDF和GDR作为引物，以广东虫草的基因组DNA为模板，按照常规PCR方法进行PCR，扩增到特异性片段。经实验发现，仅广东虫草能够扩增到特异性片段，而其他虫草样品，如冬虫夏草，古尼虫草，蛹虫草，表生虫草，巴西虫草都没有扩增到任何片段，这表明本发明的核酸分子探针GDF和GDR具有极高的专一性，可以用于快速的鉴别广东虫草(子实体和菌丝体)及其相关制品的真伪。
