本发明公开了一种具有低温活性的甘露聚糖酶ManAGN25及其基因、重组载体和重组菌。本发明提供了一种来源于鞘氨醇杆菌(Sphingobacterium sp.)的甘露聚糖酶ManAGN25,其氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示,且本发明提供了编码所述甘露聚糖酶的编码基因manAGN25,甘露聚糖酶基因manAGN25的重组载体和甘露聚糖酶基因manAGN25的重组菌。本发明的甘露聚糖酶具有以下性质:最适pH为6.5–7.0;最适温度为35–40℃,在10℃和20℃下分别具有约15%和约45%的酶活;经0.1M pH5.0–8.0缓冲液在37℃下处理60min,仍能保持60%以上的活性;37℃时半衰期约为60min。本发明的甘露聚糖酶ManAGN25可应用于水产饲料及食品行业中。