本发明公开了一种酶解卵白蛋白的方法,包括如下步骤,(1)将卵白蛋白、木瓜肽酶、L-半胱氨酸、蒸馏水均匀混合,进行酶解反应,木瓜肽酶的氨基酸序列是如SEQ ID NO:1所示的序列;(2)对(1)步酶解后的混合物加热,过滤去除未酶解的卵白蛋白残渣;(3)对步骤(2)处理后的酶解产物进行灭菌即可。本发明的优点在于,木瓜乳汁中简便、低成本、高纯度地提取出了木瓜肽酶,并且木瓜肽酶是一种天然生物活性物质,采用该肽酶对卵白蛋白进行酶解,能够得到分子量约为500-1000的小分子寡肽和氨基酸,酶解率高,并且得到的小分子寡肽和氨基酸可以作为制备治疗肝病的药物使用,也能够进一步促进机体和皮肤的吸收。