ARIZONA BOARD OF REGENTS ON BEHALF OF THE UNIVERSITY OF ARIZONA
发明人:
LI, Haiquan,ACHOUR, Ikbel,BERGHOUT, Joanne,LUSSIER, Yves A.
申请号：
USUS2017/056373
公开号：
WO2018/075332A1
申请日:
2017.10.12
申请国别(地区):
WO
年份:
2018
代理人:
摘要：
Functionally altered biological mechanisms arising from disease-associated polymorphisms remain difficult to characterize when those variants are intergenic, or, fall between genes. The present invention uses computational modelling of single-nucleotide polymorphisms (SNPs) drawn from genome-wide association studies (GWAS) or other databases to identify SNP pairs, including SNP pairs where at least one SNP is outside a protein-coding region of a gene, having convergent biological mechanisms. Additional databases, including genomic databases, biological regulatory databases, and databases related to molecular function, are used to further identify and validate the similarity of the biological mechanisms of the SNP pairs. Prioritized SNP pairs having increased similarity of biological mechanisms are then used to identify disease mechanisms, candidate therapeutic drugs, and candidate therapeutic targets among downstream effectors of intergenic SNPs.Les mécanismes biologiques fonctionnellement modifiés en raison de polymorphismes associés à une maladie restent difficiles à caractériser lorsque ces variants sont intergéniques, ou se situent entre des gènes. La présente invention utilise une modélisation informatique de polymorphismes mononucléotidiques (SNP) dérivée détudes dassociation à léchelle du génome (GWAS) ou dautres bases de données pour identifier des paires de SNP, y compris des paires de SNP dans lesquelles au moins un SNP est à lextérieur dune région codant une protéine dun gène, ayant des mécanismes biologiques convergents. Dautres bases de données, notamment des bases de données génomiques, des bases de données de régulation biologique et des bases de données concernant la fonction moléculaire, sont utilisées pour identifier plus en détail et valider la similitude des mécanismes biologiques des paires de SNP. Des paires de SNP classées par ordre de priorité présentant une plus grande similitude des mécanismes biologiques sont ensuite utilisées pour identif
