PURPOSE: An eco-friendly antifungal composition and a method for manufacturing the same are provided to ensure excellent dispersion properties and to enable long-term storage. CONSTITUTION: An eco-friendly antifungal composition contains 100 parts by weight of vegetable oil, 20-25 parts by weight of an emulsifier, and 105-110 parts by weight of purified water. The vegetable oil is selected from a group consisting of bean oil, corn oil, canola oil, sunflower seed oil, palm oil, cotton seed oil, rape oil. A method for manufacturing the composition comprises: a step of mixing the vegetable oil and the emulsifier(S101); a step of preheating the mixture at 50-60 deg. C.(S103); a step of applying a high voltage to the purified water(S105); and a step of stirring the mixture with ionized purified water(S107). [Reference numerals] (AA) Start; (BB) End; (S101) Mixture manufacturing step; (S103) Pre-heating step; (S105) Ionizing step; (S107) Dispersing step본 발명은 환경친화적인 성분으로 이루어져 토양 및 농작물을 오염시키지 않는 친환경성 진균 방제용 조성물 및 그 제조방법에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 식물성 오일, 유화제 및 정제수로 이루어지는 것을 특징으로 하는 친환경성 진균 방제용 조성물과 식물성오일과 유화제를 혼합하는 혼합물제조단계, 상기 혼합물제조단계에서 혼합된 혼합물을 50 내지 60℃로 온도로 예열하는 예열단계, 정제수에 고전압을 인가하여 정제수를 이온화시키는 이온화단계 및 고압분사 장치를 이용하여 상기 예열단계를 거친 혼합물을 상기 이온화단계를 거친 정제수와 교반하여 나노미터크기의 식물성 오일이 분산된 혼합물을 제조하는 분산단계를 포함하는 이루어지는 친환경성 진균 방제용 조성물의 제조방법에 관한 것이다.