The present invention relates to an apparatus for molding a three-dimensional (3D) dental barrier membrane. The apparatus (100) for molding the 3D dental barrier membrane comprises: a molding part (110) for molding a two-dimensional (2D) barrier membrane (10) into a 3D dental barrier membrane (10) and a handle part (150) for delivering force to the molding part (110). The molding part (110) has a male molding part (111) having a convex external shape, and a female molding part (115) having a concave external shape fit into the male molding part (111).본 발명의 3D 치과용 차폐막 성형기구(100)는 2D 치과용 차폐막(10)을 3D 치과용 차폐막(10)으로 성형하기 위한 성형부(110)와, 성형부(110)에 힘을 전달하기 위한 손잡이부(150)를 포함하고, 성형부(110)는 볼록한 외형을 갖는 수성형부(111)와 수성형부(111)에 맞는 오목한 외형을 갖는 암성형부(115)를 갖고 있다.