저온플라즈마를 이용한 다중카르복시산 에스테르화 전분 이종화합물의 제조방법이 개시된다. 본 발명에 따른 저온플라즈마를 이용한 다중카르복시산 에스테르화 전분 이종화합물의 제조방법은, a) 생전분과 카르복시산 포화용액을 혼합하여 25∼40중량%의 수분함량에 도달한 전분-카르복시산 혼합반죽을 제조하는 단계; b) 상기 전분-카르복시산 혼합반죽을 원통형 또는 필름형으로 압출성형한 후 수분함량 12~18중량%로 건조하여 반응혼합물을 제조하는 단계; 및 c) 상기 반응혼합물을 반응챔버에 넣고 목표 진공압력에 도달되도록 반응가스를 주입하면서 마이크로파를 발진하여 저온플라즈마를 형성하고, 반응혼합물을 1~30분 동안 저온플라즈마에 노출시켜 카르복시산과 전분 사이의 에스테르 화합물을 얻는 단계를 포함하는 것을 특징으로 한다. 본 발명에 의하면, 저온