发明提供了一种木聚糖酶突变体,是氨基酸序列为SEQ ID NO:1的木聚糖酶的第5位氨基酸由Pro变为Asn,第34位氨基酸由Gln变为Asn。上述木聚糖酶突变体的氨基酸序列为SEQ ID NO:2,其一种编码基因的核酸序列为SEQ ID NO:3。本发明的木聚糖酶突变体最适pH值为5.5,在酸性、中性范围内具有较高酶活,在pH2.0-5.0范围内,突变体的酶活残留率均高于野生型;木聚糖酶突变体的最适作用温度为60℃,且在70℃条件下仍能保持约80%的酶活,比野生型具有更强的耐热性。此外,本发明的木聚糖酶突变体对胃蛋白酶和胰蛋白酶也具有很强的耐受性,有利于其在饲料领域的广泛应用。