ザ ユニヴァーシティ オブ ブリティッシュ コロンビア;UNIV OF BRITISH COLUMBIA
发明人:
NEIL R CASHMAN,ニール アール． キャッシュマン,STEVEN S PLOTKIN,スティーブン エス． プロットキン,WILLIAM C GUEST,ウィリアム シー． ゲスト,ニール アール. キャッシュマン,スティーブン エス. プロットキン,ウィリアム シー. ゲスト
申请号：
JP2014119308
公开号：
JP2014167025A
申请日:
2014.06.10
申请国别(地区):
JP
年份:
2014
代理人:
摘要：
PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a method and system for predicting a misfolded protein epitope.SOLUTION: A method and system to identify an epitope unique to a misfolded form of a protein is provided. Sets of one or more amino acid residues are selected from a model representing the structure of the protein； the free energy of unfolding of each set is determined； and the epitope is identified from the sets having a total probability of unfolding above a minimum probability or a free energy of unfolding below a minimum energy. In other aspects, the invention provides for the use of epitopes identified by the epitope prediction methods, and related antibodies, to diagnose and treat disease and to screen samples for the presence of such epitopes.【課題】ミスフォールドタンパク質エピトープを予測するための方法およびシステムの提供。【解決手段】タンパク質のミスフォールド形態に固有のエピトープを同定する方法およびシステムが提供される。前記タンパク質の構造を表わすモデルから、１または複数のアミノ酸残基のセットが選択され；各セットのアンフォールディングの自由エネルギーが決定され；アンフォールディングの全確率が最小の確率を上回るか、またはアンフォールディングの自由エネルギーが最小のエネルギーを下回るセットからエピトープが同定される。他の態様において、本発明は、疾患を診断および治療し、また、エピトープ予測法により同定されるエピトープの存在について試料をスクリーニングするための、このようなエピトープおよび関連抗体の使用を提供する。【選択図】なし
