ザ ユニヴァーシティ オブ ブリティッシュ コロンビア;UNIV OF BRITISH COLUMBIA
发明人:
NEIL R CASHMAN,ニール アール. キャッシュマン,STEVEN S PLOTKIN,スティーブン エス. プロットキン,WILLIAM C GUEST,ウィリアム シー. ゲスト,ニール アール. キャッシュマン,スティーブン エス. プロットキン,ウィリアム シー. ゲスト
申请号:
JP2016177544
公开号:
JP2017033580A
申请日:
2016.09.12
申请国别(地区):
JP
年份:
2017
代理人:
摘要:
PROBLEM TO BE SOLVED: To provide methods and systems for predicting misfolded protein epitopes.SOLUTION: Provided are a method and system for identifying an epitope unique to a misfolded form of a protein. The method comprises: selecting sets of one or more amino acid residues from a model representing a structure of the protein; determining free energy of unfolding of each set; and identifying an epitope from the sets having a total probability of unfolding above a minimum probability or a free energy of unfolding below a minimum energy.SELECTED DRAWING: Figure 1【課題】ミスフォールドタンパク質エピトープを予測するための方法およびシステムの提供する。【解決手段】タンパク質のミスフォールド形態に固有のエピトープを同定する方法およびシステムであって、タンパク質の構造を表わすモデルから、1または複数のアミノ酸残基のセットを選択し、各セットのアンフォールディングの自由エネルギーを決定し、アンフォールディングの全確率が最小の確率を上回るかまたはアンフォールディングの自由エネルギーが最小のエネルギーを下回るセットからエピトープを同定する。【選択図】図1