The present invention is related to a novel process for the manufacture of an amaranth nutraceutical formulation obtained from the whole or complete seed of amaranth. The amaranth nutraceutical formulation obtained by the present invention has unique characteristics for solving problems of great relevance within the priority area of public health that affect in an important manner the population in general, such as depression, anxiety, extreme cases such as schizophrenia and bipolarity disorder.La presente invención se relaciona con un proceso novedoso para la elaboración de una formulación nutracéutica de amaranto, a partir de la semilla entera o completa de amaranto. La formulación nutracéutica de amaranto obtenida a partir de la presente invención posee características únicas para la resolución de problemas de gran relevancia dentro del área prioritaria de la salud pública que afectan significativamente a la población en general, esto es, la depresión, el estrés, la ansiedad y en sus casos extremos como son, la esquizofrenia y trastorno de bipolaridad.