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SNP marker related to low salt tolerance of panama shrimp, amplification primer and its application
专利权人:
中国科学院南海海洋研究所
发明人:
任 春華,江 暁,陳 廷,黄 文,胡 超群
申请号:
JP2018523003
公开号:
JP2019518419A
申请日:
2017.06.14
申请国别(地区):
JP
年份:
2019
代理人:
摘要:
Disclosed are SNP markers related to low salt tolerance of pansy shrimp, amplification primers and their applications. Primers were designed based on the mRNA sequence of Panaxius japonicum Na, K-ATPase α subunit obtained from NCBI (Gen Bank: KF765670.1), and PCR was carried out using the low-salt resistant and non-salt-tolerant brown shrimps genomic DNA as a template, respectively. The amplification product was amplified to obtain PCR products of 533 bp in length. Performs matching analysis on sequencing results, detects 11 SNPs from the segment sequence, and identifies SNP markers associated with low salt tolerance through association analysis of genotypes in all SNPs of these templates did. [Selected figure] Figure 1バナメイエビの耐低塩性に関連するSNPマーカー、増幅プライマーおよびその応用を開示した。NCBIから獲得したバナメイエビNa,K-ATPaseαサブユニットのmRNAシークエンス(Gen Bank:KF765670.1)をベースとしてプライマーを設計し、それぞれ耐低塩性と非耐低塩性バナメイエビのゲノムDNAをテンプレートとしてPCRの増幅を行い、それぞれ長さ533bpのPCR産物を得た。シークエンシングの結果に対する照合解析を行い、当該セグメントシークエンスから11個のSNPを検出し、これらのテンプレートのすべてのSNPにおける遺伝子型の関連分析を通じて、1つの耐低塩性に関連するSNPマーカーを確定した。【選択図】図1
来源网站:
中国工程科技知识中心
来源网址:
http://www.ckcest.cn/home/

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