The present invention provides: functional coffee beans obtained coating or inserting a Rubus coreanus fruit extract to fresh coffee beans collected from a coffee tree or processed coffee beans produced by heating the fresh coffee beans for roasting and a production method thereof. The coffee beans contain extracted components of Rubus coreanus fruit while maintaining the taste and the flavor of the coffee beans. The coffee beans contain effective components of the Rubus coreanus fruit extract for preventing the decrease of calcium and iron absorption, which is a side effect of caffeine contained in coffee, and for helping the treatment of stomach disorders.COPYRIGHT KIPO 2014본 발명은, 커피나무로부터 채취한 생두 또는 상기 생두에 열을 가하여 로스팅한 가공 원두에 복분자 추출액이 코팅 또는 내부에 침투시켜, 커피 원두에 복분자 추출성분이 함유되도록 함으로써 커피 원두의 맛과 향은 그대로 살리면서도 복분자 추출액의 유효성분을 함유하여 커피에 함유된 카페인의 부작용인 칼슘 및 철의 흡수 저하를 방지하고 위장병의 치료에 도움을 줄 수 있는 기능성 원두 커피와 그 제조 방법을 제공한다.