本发明涉及基因工程领域,具体地,本发明涉及一种耐碱中温木聚糖酶XYNAM6及其基因和应用。本发明提供了一种来源于链霉菌属Streptomycesmegasporus DSM 41476的木聚糖酶XYNAM6,其氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示,且本发明提供了编码上述木聚糖酶的编码基因xynAM6。本发明的木聚糖酶的具有以下性质:最适pH5.5,最适温度70℃,比活为242.1U/mg;极好的蛋白酶抗性,有效的降低麦芽汁黏度以及易于工业化发酵生产。做为一种新型的酶制剂,可广泛用于酿酒、食品、造纸、能源工业等。