An imaging system includes a light emitting unit that emits light for illuminating a subject that operates periodically, an imaging unit that includes an imaging device that acquires an image corresponding to a rolling shutter imaging operation, and an exposure state of the imaging device. A light emission period control unit that sets a light emission permission period and a light emission non-permission period, a basic period detection unit that detects a basic period related to the operation of the subject, and strobe light emission for causing the light emission unit to emit strobe light based on the basic period A light emission signal generation unit that generates and outputs a signal, and controls the light emission unit to emit light according to the strobe light emission signal during the light emission permission period, while preventing the light emission unit from emitting light during the light emission non-permission period. A light emission control unit that performs control.撮像システムは、周期的に動作する被写体を照明するための光を発する発光部と、ローリングシャッタ方式の撮像動作に応じた画像を取得する撮像素子を具備する撮像部と、撮像素子の露光状態に基づき、発光許可期間及び発光不許可期間を設定する発光期間制御部と、被写体の動作に係る基本周期を検出する基本周期検出部と、基本周期に基づき、発光部をストロボ発光させるためのストロボ発光信号を生成して出力する発光信号生成部と、発光許可期間においては、ストロボ発光信号に応じて発光部を発光させる制御を行う一方で、発光不許可期間においては、発光部を発光させないように制御を行う発光制御部と、を有する。