The disclosure provides methods and compositions for affecting the development of antigen presenting cell (APC, e.g., a macrophage or dendritic cell). The methods include maturing an APC, promoting anti-inflammatory phenotype, promoting development of a T regulatory cell (Treg) from a naive T cell. The methods generally include exposing an APC to a tryptophan derived microbiota metabolite (TDMM), such as an anti-inflammatory or pro-mucosal TDMM, and permitting the APC to mature. In some embodiments, the conditioned APC is exposed to a naive T cell to further promote development of a T regulatory cell (Treg). In some embodiments, the TDMM is selected from the group consisting of indole, indole-3-acetate, 5-hydroxyindole, and indole-3-pyruvate.L'invention concerne des procédés et des compositions pour affecter le développement d'une cellule présentatrice d'antigène (CPA, par exemple un macrophage ou une cellule dendritique). Les procédés consistent en la maturation d'une CPA, la promotion d'un phénotype anti-inflammatoire, et la promotion du développement d'un lymphocyte T régulateur (Treg) à partir d'un lymphocyte T naïf. Les procédés consistent de manière générale à exposer une CPA à un métabolite de microbiote dérivé du tryptophane (TDMM), tel qu'un TDMM anti-inflammatoire ou pro-muqueux, et à permettre à la CPA de devenir mature. Dans certains modes de réalisation, la CPA conditionnée est exposée à un lymphocyte T naïf pour favoriser davantage le développement d'un lymphocyte T régulateur (Treg). Dans certains modes de réalisation, le TDMM est choisi dans le groupe consistant en indole, indole-3-acétate, 5-hydroxyindole et indole-3-pyruvate.