本发明提供了一种在植物花中驱使基因表达的组织特异性启动子JcTM6基因启动子及其应用,属于转基因植物和植物基因编辑技术领域。在植物花中表达的组织特异性启动子JcTM6基因启动子的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。本发明还提供了一种含所述JcTM6基因启动子的重组载体。基于JcTM6基因启动子的活性强且具有在花中特异性表达的特点,本发明提供了组织特异性启动子JcTM6基因启动子、重组载体或所述引物在构建转基因植物或植物花、果实和种子性状改良中的应用。同时JcTM6基因启动子可作为花特异性启动子驱使功能基因表达,用于改良小桐子繁殖器官性状,实现种子产量的提高。