本发明公开了一种鉴别毛蜂窝菌(龙眼梳)的特征性核苷酸序列及其探针和方法。所述的用于鉴定毛蜂窝菌(Hexagonia apiaria)的特征性核苷酸序列来自毛蜂窝菌核糖体rRNA内转录间隔区,其序列如SEQ ID NO.1所示。以此特征性核苷酸序列为基础设计的核苷酸分子探针Probe I(如SEQ ID NO.2所示)和Probe II(如SEQ ID NO.3所示),以及包含该核酸分子探针的鉴定试剂盒,以及利用该探针通过PCR鉴别毛蜂窝菌的方法。利用本发明,可以方便、快速、准确的进行毛蜂窝菌及相关制品的快速鉴定,本发明使用分子生物学手段排除了鉴定中的人为影响、鉴定结果客观准确,鉴定时间短,半天即可完成。