The present invention comprises introducing at least one artificial nuclease system capable of cleaving a target sequence of cell genomes, donor DNA and two single stranded oligonucleotides (ssODN) into cells, wherein the artificial nuclease system is cellular Two types of SSODS are complementarily attached to each end of the cell array and the end of the donor DNA, and the donor DNA is knocked into the cleavage site via two types of ssODN, respectively. A method of knocking the donor DNA into a cell genome is provided.本発明は、細胞ゲノムの標的配列を切断可能な少なくとも1つの人工ヌクレアーゼシステム、ドナーDNA及び二種類の一本鎖オリゴヌクレオチド(ssODN)を細胞に導入する工程を含み、前記人工ヌクレアーゼシステムは細胞ゲノム上の標的配列を切断し、二種類のssODNは各々細胞ゲノムの標的配列の切断により生じた各端部とドナーDNAの各導入末端に相補性を有し、ドナーDNAは、二種類のssODNを介して切断部位にノックインされることを特徴とする、ドナーDNAを細胞ゲノムにノックインする方法を提供するものである。