The present invention relates to methods, compositions and kits concerning resistance to treatment with an anti-cancer agent, specifically an inhibitor of BRAF. In particular embodiments, the invention concerns mutations in a BRAF sequence that confer resistance to a BRAF inhibitor. Identification of such mutations in a BRAF sequence allows the identification and design of second-generation BRAF inhibitors. Methods and kits for detecting the presence of a mutant BRAF sequence in a sample are also provided.La presente invención se refiere a un método para identificar un inhibidor de BRAF de segunda generación, que comprende a) seleccionar un fármaco potencial utilizando un modelado asistido por computadora con una estructura tridimensional de cristal o de la solución de un polipéptido de BRAF mutante, en donde el polipéptido de BRAF mutante comprende una secuencia de aminoácidos que tiene al menos una sustitución de aminoácidos en comparación con un polipéptido de BRAF V600E que tiene una secuencia SEQ ID NO: 4, la al menos una sustitución de aminoácidos confiere resistencia a uno o más inhibidores de BRAF en el polipéptido de BRAF mutante, en donde la al menos una sustitución de aminoácidos se selecciona del grupo que consiste de A29, H72, S113, S124, P162, C194, L227, P231, C251, V291, Q329, K483, L495, T521, V528, D587, P655, S657, S683, P686, C696, L697, P722, F738 y C748 b) poner en contacto el fármaco potencial con el polipéptido de BRAF mutante y c) detectar la interacción del fármaco potencial con el polipéptido de BRAF mutante en donde un compuesto que es capaz de interactuar con el polipéptido de BRAF mutante se identifica como un inhibidor de BRAF de segunda generación.
