A laser system calibration method and system are provided. In some methods, a calibration plate may be used to calibrate a video camera of the laser system. The video camera pixel locations may be mapped to the physical space. A xy-scan device of the laser system may be calibrated by defining control parameters for actuating components of the xy-scan device to scan a beam to a series of locations. Optionally, the beam may be scanned to a series of locations on a fluorescent plate. The video camera may be used to capture reflected light from the fluorescent plate. The xy-scan device may then be calibrated by mapping the xy-scan device control parameters to physical locations. A desired z-depth focus may be determined by defining control parameters for focusing a beam to different depths. The video camera or a confocal detector may be used to detect the scanned depths.L'invention concerne un procédé et un système d'étalonnage de système laser. Dans certains procédés, une plaque d'étalonnage peut être utilisée pour étalonner une caméra vidéo du système laser. Les emplacements de pixels de caméra vidéo peuvent être mis en correspondance avec l'espace physique. Un dispositif de balayage xy du système laser peut être étalonné en définissant des paramètres de commande pour actionner des éléments du dispositif de balayage xy pour balayer un faisceau au niveau d'une série d'emplacements. Éventuellement, le faisceau peut être balayé au niveau d'une série d'emplacements sur une plaque fluorescente. La caméra vidéo peut être utilisée pour capturer la lumière réfléchie provenant de la plaque fluorescente. Le dispositif de balayage xy peut alors être étalonné par mappage des paramètres de commande de dispositif de balayage xy à des emplacements physiques. Un point focal de profondeur z souhaité peut être déterminé en définissant des paramètres de commande pour focaliser un faisceau à différentes profondeurs. La caméra vidéo ou un détecteur confocal peut être utilisé pour détecter