本发明涉及一种酸性中温糖化酶及其基因和应用。具体的,本发明提供了一种来源于Talaromyces emersonii CBS204.75的新的酸性中温糖化酶GAⅡ,其具有如SEQ ID NO.1或2所示的氨基酸序列,提供了编码上述糖化酶的基因,其具有如SEQ ID NO.3或4所示的核苷酸序列,以及包含该基因的重组载体、重组菌株和重组酶及其应用。本发明的糖化酶最pH4.0,在pH范围为3-6间都很稳定,是典型的酸性糖化酶;最适作用温度50℃,37℃-55℃之间能保持50%以上的活性。适合于在酒类和燃料酒精的生产、葡萄糖、果糖浆、有机酸、味精等食品工业的等多个行业中使用。