Two pairs of starter oligonucleotides for detecting the presence of alleles of the dominating or recessive immunity gene to crown rust Pc39 in the genome of common oat (Avena sativa L.), combination of two starter pairs and method for detecting of the of gene Pc39 alleles system
Przedmiotem zgłoszenia są dwie pary oligonukleotydowych starterów, mianowicie: silicoDArT2_F1 oraz silicoDArT2_R1 do wykrywania allelu dominującego genu odporności na rdzę koronową Pc39 w roślinach owsa o sekwencjach nr 1 i 2 przedstawionych na liście sekwencji oraz DArT2_F oraz DArT2_R do wykrywania allelu recesywnego genu Pc39 w roślinach owsa o sekwencjach nr 3 i 4 przedstawionych na liście sekwencji. Przedmiot wynalazku stanowi również kombinacja tych par. Przedmiotem zgłoszenia jest ponadto sposób identyfikacji allelu dominującego genu odporności na rdzę koronową Pc39 w roślinach owsa, w którym polimorficzny fragment DNA sprzężony z badanym genem amplifikowany jest w reakcji PCR z zastosowaniem pary starterów, po czym dokonuje się detekcji produktu amplifikacji, a parę starterów stanowi para oligonukleotydowych starterów o sekwencjach nr 1 i 2 przedstawionych na liście sekwencji, przy czym stosuje się marker silicoDArT2. W wyniku reakcji PCR amplifikowany jest fragment DNA o