A process for treatment of sludge made up of saline organic solids or organic waste produced in a saltwater or brackish aquaculture system is described. The process includes use of a modified reactor, operating under anaerobic conditions, which yields methane from the digestion of the saline organic solids. Modification of a traditional reactor to include a packing substrate provides for saline waste digestion not previously known. Additionally provided is a process for producing methane from the digestion of organic solids. Inclusion of and use of modified reactors in aquaculture systems is also provided.La présente invention concerne un procédé pour le traitement de boues constituées de matières solides organiques salines ou de déchets organiques salins produites dans un système daquaculture en eau salée ou saumâtre. Le procédé consiste à utiliser un réacteur modifié, fonctionnant dans des conditions anaérobies, ce qui produit du méthane provenant de la digestion des matières organiques salines. La modification dun réacteur traditionnel pour quil comprenne un substrat de garnissage permet la digestion auparavant inconnue de déchets salins. De plus, linvention concerne un procédé servant à produire du méthane à partir de la digestion de matières solides organiques. Linvention concerne également lincorporation et lutilisation de réacteurs modifiés dans des systèmes daquaculture.