A chromatographic separation process to recover a polyunsaturated fatty acid (PUFA) product from a feed mixture, comprising: (a) purifying the feed mixture in a first chromatographic separation stage using as eluent a mixture of water and a first organic solvent, obtaining an intermediate product; and (b) purifying the intermediate product in a second chromatographic separation stage using as eluent a mixture of water and a second organic solvent, obtaining the AGPI product, the second organic solvent being different from the first organic solvent, and in which the The first chromatographic separation stage comprises introducing the feed mixture into a simulated or real mobile bed chromatography apparatus, and the second chromatographic separation stage comprises introducing the intermediate product into a stationary bed chromatography apparatus.Un proceso de separación cromatográfica para recuperar un producto de ácido graso poliinsaturado (AGPI) de una mezcla de alimentación, que comprende: (a) purificar la mezcla de alimentación en una primera etapa de separación cromatográfica usando como eluyente una mezcla de agua y un primer disolvente orgánico, obteniéndose un producto intermedio; y (b) purificar el producto intermedio en una segunda etapa de separación cromatográfica usando como eluyente una mezcla de agua y un segundo disolvente orgánico, obteniéndose el producto de AGPI, siendo el segundo disolvente orgánico diferente del primer disolvente orgánico, y en el que la primera etapa de separación cromatográfica comprende introducir la mezcla de alimentación en un aparato de cromatografía de lecho móvil simulado o real, y la segunda etapa de separación cromatográfica comprende introducir el producto intermedio en un aparato de cromatografía de lecho estacionario.