The endoscope system includes an image storage unit that stores previously acquired three-dimensional image information on a subject, a virtual endoscopic image rendered endoscopically from the predetermined viewpoint position with respect to the three-dimensional image information A virtual endoscopic image generating unit that is provided in the endoscope, an imaging unit that images the inside of a predetermined hollow organ, and a position of a tip of the endoscope insertion unit in a predetermined hollow organ A virtual endoscopic image and an imaging unit generated on the two-dimensional tomographic image in which the three-dimensional image information is cut out in a predetermined direction based on the position information of the distal end of the endoscope insertion portion by the position detection unit And a candidate information presenting unit for presenting candidate position information and candidate virtual endoscopic images which are candidates for image comparison with the endoscopic image as candidate information.内視鏡システムは、予め取得した被検体における3次元画像情報を記憶する画像記憶部と、3次元画像情報に対して所定の視点位置から内視鏡的に描画した仮想内視鏡画像を生成する仮想内視鏡画像生成部と、内視鏡内に設けられ、所定の管腔臓器内を撮像する撮像部と、所定の管腔臓器内における内視鏡挿入部の先端の位置を検出する位置検出部と、位置検出部による内視鏡挿入部の先端の位置情報に基づいて3次元画像情報を所定方向に切り出した2次元断層画像上に、仮想内視鏡画像と撮像部により生成される内視鏡画像との画像比較を行う際の候補となる候補位置情報及び対応する仮想内視鏡画像を候補情報として提示する候補情報提示部と、を備える。
