A method for preventing saturation of an EMG amplifier in a system for detecting spontaneous muscle activity under a functional electrical stimulation according to the present invention comprises the steps of: setting a first counter value of a timer for a pulse output timing of the functional electrical stimulation; Setting a second counter value of the timer for the output timing of the blanking signal to take priority over the first counter value; And outputting a blanking signal based on the set second counter value and outputting a pulse of a functional electrical stimulation based on the set first counter value.본 발명에 따른 기능적 전기 자극 하의 자발 근활성 신호 검출 시스템에서의 EMG 증폭기의 포화 상태 방지 방법은 상기 기능적 전기 자극의 펄스 출력 타이밍에 대한 타이머의 제 1 카운터 값을 설정하는 단계; 상기 제 1 카운터 값보다 우선하도록 블랭킹 신호의 출력 타이밍에 대한 타이머의 제 2 카운터 값을 설정하는 단계; 상기 설정된 제 2 카운터 값에 기초하여 블랭킹 신호를 출력하는 단계 및 상기 설정된 제 1 카운터 값에 기초하여 기능적 전기 자극의 펄스를 출력하는 단계를 포함한다.