Configurations are described for conducting minimally invasive medical interventions utilizing elongate instruments and assemblies thereof to stabilize and/or fixate a sacro-iliac joint. In one embodiment, a tool assembly may be advanced from a posterior approach into the SI junction and configured to create a defect defined at least in part by portions of both the sacrum and the ilium, the defect having a three dimensional shape defined in part by at least one noncircular cross sectional shape in a plane substantially perpendicular to the longitudinal axis of the tool assembly. After a defect is created, the tool assembly may be retracted and a prosthesis deployed into the defect.細長い器具およびそのアセンブリを利用して、仙腸関節を安定化および/または固定する、低侵襲的医療介入を施行するための構成を説明する。SI関節を安定化させるためのシステムは、後方アプローチから患者の仙骨と腸骨構造との間に画定されるSI接合部の中に前進させられるように構成される欠陥生成ツールアセンブリであって、ツールアセンブリは、少なくとも部分的に、仙骨と腸骨との両方の部分によって画定される欠陥を生成するように構成され、欠陥は、ツールアセンブリの長手軸に実質的に垂直な平面において少なくとも1つの円形でない断面形状によって部分的に画定される3次元形状を有する、ツールアセンブリと、ツールアセンブリによって生成される欠陥の中に適合するように構成されるプロテーゼとを含む。