본 발명은 능성어류의 대량폐사를 유발하는 바이러스성 신경괴사증에 대해 안전한 능성어를 양식하기 위하여, 개선된 ELISA 법에 의하여 신경괴사 바이러스 무감염 능성어 친어를 선별하는 단계(Aa)와 최적화된 Nested-PCR을 통하여 신경괴사 바이러스 무감염 능성어 난 또는 정자를 선별하는 단계(Ab)를 포함하는 수직감염 경로를 차단하는 단계(A)와 능성어 양식장에서 신경괴사 바이러스 무감염 능성어를 생백신 접종과 사육온도 관리를 통하여 바이러스성 신경괴사증 내병성 능성어로 생산하는 단계(Ba)와 능성어 양식장에서 신경괴사 바이러스 감염시 능성어에 면역자극제 투여로 바이러스성 신경괴사증 내병성 능성어로 생산하는 단계(Bb)를 포함하는 수평감염 경로를 차단하는 단계(B)를 포함하는 것을 특징으로 하는 신경괴사 바이러스에 대한 내병성 능성어 생산하는 방