The present invention provides for pharmaceutical compositions comprising pancreatic enzyme preparations (PEPs) with viral infectivity reduced below significant levels and having high enzymatic activity. The PEPs can comprise lipases, proteases, amylases, non-enveloped viruses (e.g., porcine parvovirus (PPV), porcine circovirus type 2 (PCV-2), porcine encephalomyocarditis virus (EMCV)), and enveloped viruses (e.g., vesicular stomatitis virus (VSV), and influenza A (IF A)). The present invention also includes methods of treating pancreatic insufficiency by administering these pharmaceutical compositions and methods of making the same by treating the PEP with beta-propiolactone (BPL) to reduce viral infectivity.La présente invention concerne des compositions pharmaceutiques comprenant des préparations enzymatiques pancréatiques (PEP) à une infectiosité virale réduite au-dessous de niveaux significatifs et ayant une activité enzymatique élevée. Les PEP peuvent comprendre des lipases, des protéases, des amylases, des virus non enveloppés (par exemple le parvovirus porcin (PPV), le circovirus porcin de type 2 (PCV-2), le virus de lencéphalomyocardite porcine (EMCV), et des virus enveloppés (par exemple les virus de la stomatite vésiculaire (VSV) et de la grippe A (IF A)). La présente invention concerne également des procédés de traitement dune insuffisance pancréatique consistant à administrer ces compositions pharmaceutiques et des procédés produisant des effets similaires par le traitement de la PEP avec de la β-propiolactone (BPL) pour réduire linfectiosité virale.