본 발명은 지문 인식 시스템 및 이것의 지문 처리 방법 및 장치를 공개하며, 지문 인식 기술분야에 속한다. 방법 흐름은, 등록 모드에서 사용자의 손가락이 센서의 스캔 영역 중의 지정영역 내에서 슬라이딩하면, 지정영역에 의해 스캔된 복수의 이미지를 취득하는 단계; 복수의 이미지들의 동일한 특징값에 따라 상기 각 이미지를 합성하여 지문 이미지를 형성하는 단계; 지문 이미지 또는 지문 이미지의 특징값을 등록 템플릿에 저장하는 단계를 포함한다. 본 발명을 사용하면 스캔하는 시간을 줄일 수 있고, 조작이 간단할 뿐만 아니라, 지문 등록의 효율도 높인다.