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GBS获取白菜类作物基因组SNP构建指纹图谱的方法
- 专利权人:
- 中国农业科学院蔬菜花卉研究所
- 发明人:
- 孙日飞,李国亮,张淑江,程锋,李菲,章时蕃,张慧
- 申请号：
- CN201810651703.9
- 公开号：
- CN108913797A
- 申请日:
- 2018.06.22
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2018
- 代理人:
- 王文君`黄爽
- 摘要：
- 本发明提供一种基于GBS技术获取白菜类作物全基因组高密度SNP位点构建指纹图谱的方法，包括：(1)设计不同的酶切方案，预测单酶切或双酶切白菜类材料基因组所获得的酶切片段分布情况；(2)根据酶切片段分布特点设计条形码接头及PCR扩增引物；(3)构建简化基因组测序文库；(4)利用步骤(3)构建的文库进行上机测序；(5)根据测序结果获得SNP标记位点，用于构建指纹图谱。本发明为不同白菜类作物材料利用GBS构建全基因组高密度SNP图谱提供了一种通用策略，该方法降低了测序成本，酶切位点在基因组上分布均匀，利用本方法对100份白菜类材料进行了测序，费用可降低70％左右，获得的多态性位点足够用于性状分析。
- 来源网站：
- 中国工程科技知识中心
- 来源网址：
- http://www.ckcest.cn/home/
