利用长转录组测序结果装配基因组的方法及装置
- 专利权人:
- 中国水产科学研究院
- 发明人:
- 李炯棠,薛尉,汪金兔,祝雅萍,孙效文
- 申请号：
- CN201210256904.1
- 公开号：
- CN102789553B
- 申请日:
- 2012.07.23
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2015
- 代理人:
- 郭红丽
- 摘要：
- 本发明涉及一种利用长转录组测序结果装配基因组的方法及装置，该方法是将同一物种的转录组测序读段与基因组片段进行比对，去除仅比对到1个基因组片段的转录组测序读段，对保留下来的转录组测序读段上的查询区段以规定条件进行筛选，然后按照规定条件获得与保留下来的查询区段相关的区段连接，基于该区段连接对基因组片段进行连接，从而完成对基因组序列的组装。根据本发明的利用长转录组测序结果装配基因组的方法，能够利用长片段测序数据，包括现有公开的大量Sanger数据，从而能够利用长的转录组测序读段来组装基因组序列。
- 来源网站：
- 中国工程科技知识中心
