基于转录组双端测序数据组装基因组序列的方法和装置
- 专利权人:
- 中国水产科学研究院
- 发明人:
- 李炯棠,朱柏翰,肖军,孙明媛,徐桂彩
- 申请号：
- CN201610349039.3
- 公开号：
- CN106055925A
- 申请日:
- 2016.05.24
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2016
- 代理人:
- 刘向辉`王凝
- 摘要：
- 本发明提供一种基于转录组双端测序数据组装基因组序列的方法，所述方法包括将转录组双端测序序列比对到基因组上，保留双端测序序列分别仅能比对唯一的不同基因组序列以及基于最多转录组双端测序序列连接证据的基因组序列拼接筛选、形成新的基因组序列等步骤。本发明还提供实现上述方法的装置。利用本发明方法，通过将转录组双端测序序列比对到基因组上，获得基于最多双端测序比对结果的连接证据，从而进行基因组序列的拼接组装，以提升基因组的完整性。转录组双端测序数据既可以是公共数据库中该物种的转录组双端测序序列，也可以是实验产生的转录组双端测序数据。
- 来源网站：
- 中国工程科技知识中心
