本发明提供了一种二穗短柄草抗旱基因和表达载体及其编码蛋白质与应用。该基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的序列或与SEQ ID NO.1所示的序列互补的核苷酸序列。该蛋白质由权利要求1所述的基因编码得到,所述蛋白质的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。所述基因用于在提高植物对干旱胁迫的耐受性方面的应用。本发明所述基因调节植物通过关闭气孔减少蒸腾作用损失的水分;在干旱条件下具有更发达的根系保证水分吸收;能够提高抗氧化酶系统中过氧化氢酶、过氧化物酶、超氧化物歧化酶等酶活力以及时清除活性氧ROS,降低活性氧对细胞造成的氧化损伤,提高植物对干旱的耐受性。