The present invention describes an efficient method for separating L-fucose from fermentation medium. L-fucose contained in the fermentation broth is produced by bacterial fermentation. The method of the present invention includes the step of removing biomass from the fermentation medium, applying the resulting solution to one or more of cation exchanger treatment and anion exchanger treatment and removing salt after ion exchanger treatment. According to this method, L-fucose can be provided in a spray-dried form and a crystalline form.본 발명은 발효 배지로부터 L-푸코스(L-fucose)를 분리하기 위한 효율적인 방법을 기술한다. 발효액에 포함된 L-푸코스는 박테리아 발효에 의해 생성된다. 본 발명의 방법은 발효 배지로부터 바이오매스를 제거하는 단계, 생성된 용액을 양이온 교환기 처리 및 음이온 교환기 처리 중 하나 이상에 적용하는 단계 및 이온 교환기 처리 후 염을 제거하는 단계를 포함한다. 이 방법에 의하면 L-푸코스를 분무-건조 형태 및 결정 형태로 제공할 수 있다.