A system for protecting a floating fish cage is disclosed. According to an embodiment of the present invention, provided is the system for protecting the floating fish cage comprising: a plurality of door units installed in the sea and installed in a cage unit for culturing fish and shellfish therein to be opened and closed a harmful algae sensor installed on one side of the cage unit for detecting harmful algae a control unit for closing the door unit when generation of the harmful algae is detected by the harmful algae sensor to prevent the harmful algae from being introduced into the cage unit an algae removal vessel for collecting the harmful algae outside the cage unit.COPYRIGHT KIPO 2017가두리양식장 보호 시스템이 개시된다.본 발명의 일 실시예에 따르면, 해양에 설치되어 내부에 어패류를 양식하는 가두리유닛에 설치된 개폐 가능한 복수개의 도어부 상기 가두리유닛의 일측에 설치되어 유해 조류를 감지하는 유해 조류감지센서 상기 유해 조류감지센서에 의해 상기 유해 조류의 발생이 감지되면 상기 도어부를 폐쇄하여 상기 유해 조류가 상기 가두리유닛 내부로 유입되는 것을 차단하는 제어부 및 상기 가두리유닛 외부의 상기 유해 조류를 포집하는 조류제거선박을 포함하는 가두리 양식장 보호 시스템이 제공될 수 있다.