本发明公开了一种具有拆分消旋体γ-内酰胺活性的(-)γ-内酰胺酶及其编码基因与应用,其是来源于大豆慢生根瘤菌(Bradyrhizobium japonicum USDA6)的(-)γ-内酰胺酶及其编码基因,还提供了该(-)γ-内酰胺酶水解拆分消旋体γ-内酰胺的应用。本发明所述(-)γ-内酰胺酶是如下(a)或(b)的蛋白质:(a)由序列表中的SEQ ID No:1的氨基酸残基序列组成的蛋白质;(b)将序列表中的SEQ ID No:1氨基酸残基序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有拆分消旋体γ-内酰胺活性的由SEQ ID No:1衍生的蛋白质。利用该(-)γ-内酰胺酶水解拆分消旋体γ-内酰胺,其拆分活性接近100%,进而利用催化产物氨基酸制备(-)γ-内酰胺。