A medical image overlay method and apparatus are disclosed that include a heart site. A medical image overlay method according to an embodiment of the present invention includes: receiving a first medical image including an image of a heart part of a subject; Receiving a second medical image including an image of the heart region of the subject; Extracting two-dimensional cardiovascular information from the received first medical image and extracting three-dimensional cardiac information from the second medical image; Extracting transformation matrix information between the first medical image and the second medical image using the extracted two-dimensional cardiovascular information and matching of three-dimensional cardiovascular information included in the three-dimensional cardiac information; And applying the extracted transformation matrix information to the 3D cardiac information and overlaying the 3D cardiac information to which the transformation matrix information is applied on the first medical image.심장 부위를 포함하는 의료 영상 오버레이 방법 및 그 장치가 개시된다. 본 발명의 일 실시예에 따른 의료 영상 오버레이 방법은 피검자의 심장 부위의 영상을 포함하는 제1 의료 영상을 수신하는 단계; 상기 피검자의 상기 심장 부위의 영상을 포함하는 제2 의료 영상을 수신하는 단계; 상기 수신된 상기 제1 의료 영상으로부터 2차원 심혈관 정보를 추출하고, 상기 제2 의료 영상으로부터 3차원 심장 정보를 추출하는 단계; 상기 추출된 상기 2차원 심혈관 정보와 상기 3차원 심장 정보에 포함된 3차원 심혈관 정보의 정합을 이용하여 상기 제1 의료 영상과 상기 제2 의료 영상 간의 변환 행렬 정보를 추출하는 단계; 및 상기 추출된 상기 변환 행렬 정보를 상기 3차원 심장 정보에 적용하고, 상기 변환 행렬 정보가 적용된 상기 3차원 심장 정보를 상기 제1 의료 영상에 오버레이(overlay)시키는 단계를 포함한다.