methods and systems for producing biofuels. The present invention relates to a method for producing biofuels which is provided. One method for making biofuels include dehydrating substantially intact algal cells to make an algae biomass, sequentially adding solvent pools to the algae biomass, and sequentially separating solid biomass fractions from liquid fractions to arrive at a liquid fraction comprising neutral lipids. The method also includes esterifying neutral lipids； separating a water-miscible fraction comprising glycerin from a water-immiscible fraction comprising combustible esters, carotenoids and omega-3 fatty acids. The method also includes obtaining a fraction of c16 or shorter fuel esters, a fraction of c16 or longer fuel ester and a residue comprising carotenoids and omega-3 fatty acids. The method also includes hydrogenating and deoxygenating at least one of (i) c16 or shorter fuel esters to obtain a jet fuel mixture stock and (ii) c16 or longer fuel esters to obtain a diesel mixture stock.métodos e sistemas para produzir biocombustíveis. a presente invenção refere-se a um método para produzir biocombustíveis que é fornecido. um método para fazer biocombustíveis incluir desidratar células de algas substancialmente intactas para fazer uma biomassa de algas, sequencialmente adicionar conjuntos de solventes à biomassa de algas e sequencialmente separar frações de biomassa sólida das frações líquidas para chegar em uma fração líquida compreendendo lipídios neutros. o método também inclui esterificar os lipídios neutros； separar uma fração miscível em água compreendendo glicerina de uma fração imiscível em água compreendendo ésteres combustíveis, carotenóides e ácidos graxos ômega-3. o método também inclui obter uma fração de ésteres combustíveis c16 ou mais curtos, uma fração de éster combustível c16 ou mais longos e um resíduo compreendendo carotenóides e ácidos graxos ômega-3. o método também inclui hidrogenar e desoxigenar pelo menos um de (i) os ést
