本发明涉及基因工程领域,具体地,本发明涉及一种具有双结构域的低温中性植酸酶PhyH及其基因和应用。本发明提供了一种来源于芽孢杆菌属Bacillus sp.HJB17的中性植酸酶PhyH,其氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示,且本发明提供了编码上述中性植酸酶的编码基因PhyH。本发明的植酸酶具有良好的pH稳定性,在碱性范围内依然保持较高酶活;在低温范围具有较高的相对酶活;具有双结构域,N端为一个不完整的BPP植酸酶结构域;C端是一个完整的植酸酶的结构域。总之,本发明获得的PhyH作为一种低温中性植酸酶可以应用于渔业养殖生产;其PhyH-DI结构域可以提高其他植酸酶的催化效率,有助于其改进其他植酸酶的生产和应用。