本发明公开了一种脂肪酶重组大肠杆菌表达菌株、重组脂肪酶和应用,方法如下:(1)将脂肪酶GZEL基因克隆到pFL‑B62cl表达载体上,构建得到重组质粒;所述脂肪酶GZEL基因的碱基序列如SEQ ID NO:2所示;(2)将所得的重组质粒转化大肠杆菌Shuffle T7感受态细胞,挑选阳性克隆,获得重组大肠杆菌表达菌株。以获得的重组大肠杆菌表达菌株为发酵菌株进行液体发酵,制备重组脂肪酶。本发明酶来源方便,发酵工艺简单、成本低;本发明同时公开了该酶在植物油酶法脱胶中的应用。将所制备的重组脂肪酶在30℃条件下脱胶反应3h即可将毛油中的磷含量降低到10mg/kg以下,与传统酶法脱胶工艺相比,能降低反应能耗。