The present invention relates to a composition for the treatment and prevention of intestinal diseases comprising an active peptide derived from clamidomonas as an active ingredient. More particularly, the present invention relates to a composition for treating and preventing intestinal diseases, And a composition for treating and preventing a bowel-related disease comprising an active peptide derived from Midomonas as an active ingredient. The active peptide derived from Kramidomonas of the present invention reduces tight junction damage of normal intestinal cells caused by excessive activation of intestinal glial cells, reduces oxidative stress in normal intestinal cells, It can be effectively used as a pharmaceutical composition and health functional food for treating or preventing various enteric diseases.본 발명은 클라미도모나스 유래 활성 펩타이드를 유효성분으로 포함하는 장 질환 치료 및 예방용 조성물에 관한 것으로, 더 상세하게는 장 신경교세포의 과도한 활성을 억제하여 정상 장 세포를 보호하는 효과를 발휘하는 클라미도모나스 유래 활성 펩타이드를 유효성분으로 포함하는 장 관련 질환 치료 및 예방용 조성물에 관한 것이다. 본 발명의 크라미도모나스 유래 활성 펩타이드는 장 신경교세포의 과도한 활성화로 야기되는 정상 장세포의 밀착 결합(tight junction) 손상을 감소시키고, 정상 장 세포 내의 산화적 스트레스를 감소시키며, 정상 장 세포의 세포사멸을 억제하는 효과를 가지고 있어 다양한 장 질환 치료 또는 예방을 위한 약학적 조성물 및 건강기능식품으로 유용하게 이용될 수 있을 것이다.