A medical image processing device which produces an image that highlights the difference in color between normal areas and abnormal areas, such as atrophied areas of the gastric mucosa, an operation method thereof, and an endoscope system are provided. RGB image signals are inputted. The B/G ratio is calculated from the B image signal and the G image signal, and the G/R ratio is calculated from the G image signal and the R image signal. In the feature space formed from the B/G ratio and the G/R ratio, first processing is performed such that, in a state in which coordinates of a first and third area are maintained, the coordinates of a second area are moved to a reference area which includes the origin. In order to separate the coordinates of the first area and the coordinates of the third area from one another, second processing is performed for moving the coordinates of the first area and the coordinates of the third area. After the first and second processing, a first special image is produced on the basis of the B/G ratio and the G/R ratio.L'invention concerne un dispositif de traitement d'image médicale qui produit une image qui met en évidence la différence de couleur entre des zones normales et des zones anormales, telles que des zones atrophiées de la muqueuse gastrique, un procédé de fonctionnement de ce dernier, et un système d'endoscope. Des signaux d'image RVB sont entrés. Le rapport (B/V), entre le signal d'image B et le signal d'image V, est calculé et le rapport (V/R), entre le signal d'image V et le signal d'image R, est calculé. Dans l'espace de caractéristiques formé dans le rapport B/V et le rapport V/R, le premier traitement est effectué de telle sorte que, dans un état dans lequel les coordonnées d'une première et d'une troisième zone sont conservées, les coordonnées d'une deuxième zone sont déplacées à une zone de référence qui comprend l'origine. Afin de séparer les coordonnées de la première zone et les coordonnées de la troisième zone les une
