本发明公开了一种高温碱性果胶酸裂解酶Pel-863及其编码基因和应用,所涉及的果胶酸裂解酶基因编码序列如SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.2所示,氨基酸序列如SEQ ID NO.3或SEQ ID NO.4所示。该果胶酸裂解酶基因来源于热解纤维素菌Caldicellulosiruptor kronotskyensis,该酶可在70-75℃、pH9.0-9.5以及Ca2+存在条件下高效降解多聚半乳糖醛酸(PGA)和果胶,并且具有较好的温度和pH稳定性。另外,Pel-863对麻纤维、苹果渣及天然秸秆中的果胶质成分均有较好的降解效果,可应用于纺织、造纸及生物能源等领域。