It is an object to produce a functional intestinal organoid from pluripotent stem cells. (1) a step of differentiating pluripotent stem cells into endoderm-like cells, (2) a step of differentiating endoderm-like cells obtained in step (1) into intestinal stem cell-like cells, and (3) step (2) C) culturing the intestinal stem cell-like cells obtained in step (a) to form spheroids, and (4) differentiating the spheroids formed in step (3) to form intestinal organoids, In addition to BMP inhibitors and Wnt signal activators, a process comprising culturing in the presence of a MEK1 / 2 inhibitor, a DNA methylation inhibitor, a TGFβ receptor inhibitor and a γ-secretase inhibitor, Intestinal organoids are made from stem cells.多能性幹細胞から機能的な腸管オルガノイドを作製することを課題とする。(1)多能性幹細胞を内胚葉様細胞へと分化させる工程、(2)工程(1)で得られた内胚葉様細胞を腸管幹細胞様細胞へと分化させる工程、(3)工程(2)で得られた腸管幹細胞様細胞を培養し、スフェロイドを形成させる工程、及び(4)工程(3)で形成されたスフェロイドを分化させ、腸管オルガノイドを形成させる工程であって、上皮成長因子、BMP阻害剤及びWntシグナル活性化剤に加えて、MEK1/2阻害剤、DNAメチル化阻害剤、TGFβ受容体阻害剤及びγ-セクレターゼ阻害剤の存在下での培養を含む工程によって、多能性幹細胞から腸管オルガノイドを作製する。