The present invention relates to a preparation method of sprouted flaxseeds with mucilage removed, and, more specifically, to a preparation method of sprouted flaxseeds, which comprises a step of removing characteristic mucilage, a step of sprouting flaxseeds, and a step of removing an oil component of the sprouted flaxseeds and fermenting. According to the preparation method of sprouted flaxseed according to the present invention, the process and the cost required to cultivate sprouted flaxseeds by removing mucilage of flaxseed through physical steps without a separate enzyme solution process, and provides sprouted flaxseeds with increased in vivo absorption rate by fermenting after removing the oil component of sprouted flaxseeds which allows to preserve the nutrients and removes toxin.COPYRIGHT KIPO 2014[Reference numerals] (30) Step of fermenting flaxseeds (S11) Step of dipping flaxseeds (S12) Step of dehydrating flaxseeds (S21) Step of supplying moisture to flaxseeds (S22) Step of stirring, supplying oxygen and stabilizing flaxseeds (S23) Step of drying flaxseeds본 발명은 점액질이 제거된 아마씨 발아체의 제조방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 아마씨의 발아체를 얻기 위해 특유의 점액질을 제거하는 단계, 아마씨를 발아시키는 단계, 아마씨 발아체의 오일 성분을 제거하고 발효시키는 단계를 거쳐 아마씨 고유의 영양성분이 손실없이 보존되는 아마씨 발아체 제조 방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 아마씨 발아체 제조방법에 의하면, 별도의 효소액 처리를 거치지 않고 물리적인 단계만을 거쳐 아마씨의 점액질을 제거함으로써 아마씨 발아체를 배양하는 데 요구되는 공정과 비용을 최소화할 수 있으며, 발아된 아마씨의 오일 성분을 제거한 뒤 발효시킴으로써 아마씨에 함유된 영양소를 보존하고 독소를 제거하여 체내 흡수율을 높인 발효된 아마씨 발아체가 제공된다.