本发明公开了一种与猪饲料转化效率性状相关的分子标记及检测方法和应用,该分子标记位于猪的Orexin基因核苷酸序列中,在SEQ ID NO:1的第516 bp处有一个G516‑A516的碱基突变。利用引物:TCATCTCATTTCCCCCTCCCAGC;和GAAAACTTCACCCAGGCAAACAGAGGCCCTATTTAGC对该基因进行扩增,酶切后可准确检测猪的基因型。同时运用混合模型来统计分析Orexin基因SNP位点的基因型效应及其与饲料转化效率性状的关系,发现此多态位点与平均日增重、采食量、剩余采食量等饲料转化效率性状显著相关,促进了对猪饲料转化效率的研究进展。