本发明提供一种与猪背膘厚性状相关的SNP分子标记及其检测方法。对不同猪品种MARK4基因外显子区进行检测，发现MARK4基因3’UTR区第55位碱基(mRNA全长第2581位碱基)存在1处SNP位点(G-A)，等位基因A与低背膘性状呈正相关，而等位基因G与高背膘性状呈正相关。本发明提供了检测该SNP分子标记的方法，利用核苷酸序列如SEQ ID NO.1-2所示的引物对扩增待测猪基因组DNA并用pstI酶切，若酶切产物为251bp，突变处碱基为A，若酶切产物为218bp，则突变处碱基为G。本发明方法能够早期、快速、低成本、有效的预测猪背膘厚度，可做为一个有用的分子标记应用于猪种的遗传改良。
